Conocer tu predisposición genética a padecer enfermedades comunes, crónicas y que pueden ser tratadas con fármacos, puede ayudarte a prevenirlas.
¿Preparados para traspasar los límites de la genética?
Un año más, en Health in Code tenemos el honor de participar en el IV Congreso Interdiciplinar en Genética Humana, que se celebrará del 15 al 17 de Noviembre en Málaga. Este congreso es la oportunidad perfecta para compartir y debatir con expertos de todas las áreas sanitarias, el papel de la genética.
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La miocardiopatía hipertrófica (MCH) es el trastorno cardíaco hereditario más frecuente, y en un 60% de los casos se desconoce la etiología genética responsable. En este centro gallego se ha identificado una variante recurrente en TNNT2, p.Asn271Ile, asociada a MCH. El objetivo es determinar si los portadores de esta variante comparten un haplotipo común y estimar la edad de la mutación. Esta variante patogénica explica más del 1% de los casos de MCH en la población gallega. Se ha demostrado un efecto fundador, surgiendo la variante hace aproximadamente 650 años.
Este trabajo muestra los resultados de nuestra experiencia tras 5 años realizando estudios de NGS dirigidos a >500 genes asociados a enfermedades del sistema inmune (SI) en una cohorte de 517 pacientes con sospecha de inmunodeficiencias primarias (IDPs). De los 4 grupos fenotípicos considerados (IDPs de inmunidad adaptativa, IDPs de inmunidad innata, enfermedades autoinflamatorias y enfermedades de desregulación del SI), las IDPs de inmunidad adaptativa fueron las de mayor rendimiento diagnóstico. Mediante esta aproximación, identificamos 30 variantes nóveles consideradas causales y aportamos nuevas evidencias sobre la inclusión de algunos genes asociados al desarrollo de IDPs.
Se realizó un estudio retrospectivo con 2896 muestras de sangre periférica, con el fin de ver aquellas mutaciones con una frecuencia alélica entre el 7 y el 30% (potenciales mosaicismos) detectadas en estudios germinales mediante NGS, que podrían estar participando en la predisposición al cáncer. En seis de los casos se identificaron variantes patogénicas con esa frecuencia en estos genes NF1, ATM, TP53, PTEN, PIK3CA y VHL. Las variantes detectadas entre los genes más frecuentemente reportados en mosaico.
Se realizó un exoma dirigido, con genes asociados a discapacidad intelectual, a una mujer de 23 años con talla baja, obesidad mórbida, retraso mental, braquidactilia, rasgos faciales dismórficos y sin alteraciones hormonales ni iónicas. Se identificaron dos variantes patogénicas en el gen PRMT7, las cuales habían sido heredadas. El diagnóstico clínico de sospecha fue osteodistrofia hereditaria de Albright. Por lo tanto, el gen PRMT7 debe valorarse para formas sindrómicas de obesidad, como el pseudohipoparatiroidismo de tipo 1A y 1C (osteodistrofia de Albright), la acrodisostosis y del síndrome de deleción 2q37.
El objetivo de este estudio retrospectivo es evaluar la rentabilidad y el espectro mutacional en 471 pacientes con miocardiopatía hipertrófica (MCH) diagnosticados en edad pediátrica, mediante NGS. La rentabilidad del estudio genético en nuestra cohorte de pacientes pediátricos con MCH diagnosticados es del 53%. En pacientes <1 año las variantes asociadas a MCH en enfermedad sindrómica representan la mitad de los casos, mientras que en >1 año las variantes patogénicas en genes sarcómericos fueron las más frecuentes.
El objetivo fue realizar un análisis de correlación genotipo-fenotipo con respecto a portadores heterocigotos simples de ALPK3nv y la miocardiopatía hipertrófica (MCH). Se secuenció ALPK3 en 16.780 probandos con un panel ampliado de NGS (6.505 de los cuales fueron evaluados por MCH). Variantes nulas de ALPK3 en heterocigosis simple pueden explicar el 1,7% de las MCH. Se asociaron con enfermedad de inicio tardío, especialmente en mujeres, principalmente con formas apicales y/o concéntricas, y fenotipo no muy grave.
Se realizó un estudio genético mediante una librería de captura NGS a 205 pacientes con sospecha de poliquistosis renal. El estudio se complementó con el análisis de amplicones de la región pseudogénica de PKD1. Se identificaron 40 variantes no-truncantes (3 missense) de significado incierto (VUS) en PKD1. En base a los criterios de clasificación ACMG, podemos reclasificar las variantes a posiblemente patogénicas considerando los criterios PS4 y PM2, complementado con estudios de co-segregación familiar.
Se realizó un estudio NGS a una mujer con neurofibromatosis tipo 1, para el análisis de SNVs e indels en la región codificante y los sitios de empalme del gen NF1. Se detectaron en trans dos variantes patogénicas, en distintos grados de mosaicismo, tanto en sangre como en frotis bucal. La frecuencia alélica sugiere una mutación de novo en uno de los dos alelos de NF1 en el embrión. Un error de reversión pudo originar una reparación alternativa de la mutación en la hebra complementaria.
El objetivo de este trabajo fue determinar, a través de un estudio retrospectivo, el porcentaje de casos en los que se han identificado CNVs como causa de miocardiopatía dilatada (MCD) en 6.512 pacientes. Se realizó el análisis mediante NGS. Las CNVs explicaron un 1.02% de los casos, siendo DMD el gen más frecuente. Nuestros resultados sugieren que el análisis sistemático de CNVs en estudios NGS es importante para optimizar el rédito diagnóstico de esta enfermedad.
Se estudiaron 35 pacientes con sospecha de síndrome autoinflamatorio mediante NGS. La interpretación de las variantes se realizó según el cumplimiento de los criterios descritos en las guías. Se identificaron 23 variantes de las que 69.6% resultaron VUS. Su categorización por impacto reveló que 14 presentarían una probabilidad menor al 50% de resultar patogénicas, y únicamente 2 resultarían candidatas a confirmar su patogenicidad mediante estudios adicionales. Otras 4 variantes fueron patogénicas, y las 3 restantes probablemente benignas.
La causa genética más frecuente de la nefropatía tubulointersticial autosómica dominante es la inserción de una base nucleotídica en la región de repeticiones en tándem de numero variable (VNTR) del gen MUC1. El objetivo es mejorar la identificación de variantes en la región la región VNTR del gen MUC1. Se identificaron 6 pacientes con 2 variantes esta región: p.Gln163fs y p.Ala144fs. Ambas se producen por la inserción de una citosina, ocasionando un cambio en el marco de lectura y, por tanto, la terminación temprana de la proteína.
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