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Action ST OncoKit

Protocol automated using Magnis NGS Prep System

Descripción

Análisis de biomarcadores genómicos de utilidad genética mediante secuenciación masiva

Formato

24 rxn

Tecnología

NGS

Referencia

IMG-419

Equipos compatibles

NextSeq 500/550Dx System

Protocol automated using Magnis NGS Prep System
Kit Health in Code
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  • Permite la detección de mutaciones puntuales (SNVs), pequeñas inserciones y deleciones (INDELs), variantes estructurales (SVs), variantes del número de copias a lo largo del genoma (CNVs), inestabilidad de microsatélites (MSI) y variantes asociadas con la farmacogenética (PGx).
  • Marcado molecular con UMIs que aumenta la sensibilidad del análisis bioinformático.
  • Software de análisis incluido: Data Genomics.
  • Cobertura: >99% de las bases cubiertas a una profundidad de 200X.
  • Uniformidad: 98% de las bases cubiertas a >20% de la mediana de cobertura.
  • Sensibilidad: > 99%.
  • Especificidad: > 99%.
  • El límite de detección (LOD) de SNVs, INDELs y SVs es del 5%.
  • El límite de detección de las CNVs es de 2.4 copias totales para ganancias, lo que supone 4 copias al 30% de representación tumoral y de 1.8 copias totales para pérdidas, es decir, 1 copia al 20% de celularidad tumoral.

Action ST OncoKit emplea una tecnología de preparación de librerías que integra la fragmentación enzimática del ADN, la captura de alta sensibilidad de las regiones de interés mediante sondas de hibridación y el marcado molecular de cada fragmento de ADN con un adaptador único. Posteriormente, la secuenciación masiva se lleva a cabo en plataformas de Illumina.

  • Secuenciadores compatibles: NextSeq 500/550Dx System
  • Número de reacciones: 24
  • Número de muestras por run: Mid Output v2.5 kit (150 ciclos): 8 muestras
  • Secuenciación: Paired-end (2 x 75 ciclos)
  • Cantidad de ADN por muestra: 10-200 ng
  • Región genómica analizada: 500 Kb
  • Tipo de muestra: ADN procedente de tejido embebido en parafina
Action ST OncoKit: MSDS
Action ST OncoKit: Manual de uso
Certificado de análisis

Action ST OncoKit

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