Action ST OncoKit

Análisis de los principales biomarcadores genómicos de utilidad clínica para el diagnóstico, pronóstico, sensibilidad y/o resistencia terapéutica de un amplio abanico de tumores sólidos como cáncer de pulmón, mama y colorrectal, entre otros, mediante secuenciación masiva.

24 rxn

NGS

IMG-419

Illumina NextSeq 500 e Illumina NextSeq 550DX.

  • Permite la detección de mutaciones puntuales (SNVs), pequeñas inserciones y deleciones (INDELs), variantes estructurales SVs y variantes del número de copias a lo largo del genoma (CNVs).
  • Marcado molecular con UMIs que aumenta la sensibilidad del análisis bioinformático.
  • Software de análisis incluido: Data Genomics.
  • Cobertura: >99% de las bases cubiertas a una profundidad de 200X.
  • Uniformidad: 98% de las bases cubiertas a >20% de la mediana de cobertura.
  • Sensibilidad: > 99%.
  • Especificidad: > 99%.
  • El límite de detección (LOD) de SNVs, INDELs y SVs es del 5%.
  • El límite de detección de las CNVs es de 2.4 copias totales para ganancias, lo que supone 4 copias al 30% de representación tumoral y de 1.8 copias totales para pérdidas, es decir, 1 copia al 20% de celularidad tumoral.
  • Cumple con los requisitos de calidad especificados por la ISO 9001 e ISO 14001 en lo referente a los materiales empleados en su proceso de fabricación.
  • Secuenciadores compatibles: Illumina NextSeq 500 e Illumina NextSeq 550DX.
  • Número de reacciones: 24.
  • Número de muestras por run: Mid Output v2.5 kit (150 ciclos): 8 muestras.
  • Secuenciación: Paired-end (2 x 75 ciclos).
  • Cantidad de ADN por muestra: 10-200 ng.
  • Región genómica analizada: 500 Kb.
  • Tipo de muestra: ADN procedente de sangre periférica y tejido parafinado.

Action ST OncoKit

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