Targeted Liquid Biopsy OncoKit

Protocol automated using Magnis NGS Prep System

Análisis de los principales biomarcadores de interés clínico en cáncer de pulmón no microcítico y otros tumores sólidos

24 rxn

Secuenciación NGS

IMG-415

Secuenciadores compatibles: Illumina NextSeq500/550 y NextSeq550Dx System. Magnis NGS Prep System Dx

Protocol automated using Magnis NGS Prep System
  • Caracterización de ctDNA obtenido a partir de biopsia líquida.
  • Permite la detección, a partir de una sola muestra de DNA, de SNVs, indels, fusiones génicas y CNVs.
  • Análisis bioinformático con el software Data Genomics y generación de informes semiautomáticos con la clasificación funcional y clínica de las variantes.
  • Basado en tecnología de sondas de RNA de alta sensibilidad con marcado molecular UMI (marcadores moleculares únicos).
  • Cobertura media: 7300X y cobertura media tras análisis de UMIs: 2500X.
  • Los resultados de especificidad, sensibilidad y repetibilidad son >99% y de reproducibilidad >97% para este kit. La cobertura (a una profundidad >100X) y la uniformidad de las bases cubiertas a >20X es >96%.
  • Cumple con los requisitos de calidad especificados por la ISO 9001 e ISO 14001 en lo referente a los materiales empleados en su proceso de fabricación.
  • Software de análisis con marcado CE/IVD.
  • Secuenciadores compatibles: Illumina NextSeq500/550 y NextSeq550Dx System
  • Número de reacciones: 24
  • Número de muestras por carrera: de 8 muestras en un cartucho HIGH 150 ciclos en el NextSeq
  • Secuenciación: Paired-end (2 x 75 ciclos)
  • Tipo de muestra: ADN libre circulante procedente de biopsia líquida
  • Cantidad de ADN de partida: 10-50 ng.
  • Límite de detección: SNV, Indels y variantes estructurales: 1%; CNVs: ganancias de 2,9 copias totales
  • Panel totalmente automatizado en el equipo robot Magnis NGS Prep System Dx

Targeted Liquid Biopsy OncoKit

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