Errores innatos del metabolismo

Tiempo de respuesta: 35 días

Servicio de secuenciación e interpretación de genes individuales. En función de su tamaño y de las regiones de interés, podemos ofrecer un abordaje basado en secuenciación Sanger o en NGS (enriquecimiento por amplicones o mediante sondas de hibridación). La aproximación basada en NGS permite la detección de variación en el número de copias (CNV).

Tiempo de respuesta: 35 días

Next Generation Sequencing (NGS), o secuenciación masiva, es un término utilizado para describir un conjunto de nuevas tecnologías capaces de realizar una secuenciación masiva de ADN. Esto significa que millones de pequeños fragmentos de ADN pueden ser secuenciados al mismo tiempo, creando una gran cantidad de datos. Estos datos pueden alcanzar hasta gigabites de información, que es el equivalente de 1.000 millones de pares de bases de ADN. En comparación, los métodos anteriores podían secuenciar únicamente un fragmento de ADN cada vez, generando entre 500 y 1.000 pares de bases de ADN en una sola reacción.

NextGenDx^® está indicado en los casos que se pretenda analizar un grupo determinado de genes concretos con la máxima precisión diagnóstica. Dirigido a:

• Enfermedades monogénicas o asociadas a pocos genes de gran tamaño.
• Enfermedades multigénicas o genéticamente heterogéneas cuyo diagnóstico diferencial resulta complejo.

Tiempo de respuesta: 35 días

Técnica semicuantitativa y ampliamente contrastada en los laboratorios de genética molecular que permite el diagnóstico de patologías debidas a variación en el número de copias y, en algunos casos, a alteraciones de metilación. Existen multitud de kits comerciales para el estudio de genes individuales, paneles de genes relacionados con patologías determinadas o regiones cromosómicas extensas involucradas en síndromes de microdeleción/microduplicación. HIC ofrece servicios MLPA basados en los kits de MRC-Holland.

Tiempo de respuesta: 35 días

También se conoce como cariotipo molecular y su principal ventaja frente al cariotipo es su gran sensibilidad, permitiendo la detección de variaciones estructurales que pasan desapercibidas en un cariotipo. La tecnología de CGH-array permite analizar pérdidas o ganancias de material genético y reordenamientos no equilibrados en el genoma completo de un individuo.

El CGX postnatal 180K está diseñado especialmente para el diagnóstico genético. Posee una resolución media a lo largo de todo el genoma de 100 kb y una resolución alta de 20 kb en las regiones de interés del genoma (regiones que presentan una asociación directa entre variación en el número de copias y alguna patología o síndrome descrito).

El array prenatal 37K está especialmente diseñado para el diagnóstico prenatal para detectar en una sola prueba la presencia de alteraciones genéticas y cromosómicas. Su resolución es 10 veces mayor que la de un cariotipo convencional y 50 veces mayor en las regiones críticas de los principales síndromes. Sin disminuir sustancialmente la resolución en las regiones de interés, el GCX 37K presenta una baja cobertura en el resto del genoma con el fin de minimizar al máximo la incertidumbre diagnóstica.

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Estudios de portadores de variantes previamente descritas en la familia mediante secuenciación Sanger.

Para variantes estructurales (reordenamiento, variación copy-number [inserciones, deleciones y duplicaciones], inversiones, translocaciones, etc. consulta en atencionalcliente@healthincode.com

El proceso normal de transcripción génica permite la correcta eliminación de los intrones y la unión de los exones (proceso de splicing) en el ARN mensajero para generar una proteína funcional. Los avances en genómica han permitido expandir la secuenciación a regiones no codificantes alejadas de las zonas canónicas que flanquean los exones. Se considera que las variantes que afectan al splicing del pre-ARNm (variantes espliceogénicas) son causa de la enfermedad con una frecuencia estimada del 15-50 %, dependiendo de la patología a estudio.

Estas variantes pueden inducir la exclusión del exón, la activación de sitios crípticos de splicing o la retención total o parcial del intrón, generando un patrón de lectura anómalo. Con frecuencia, estas anomalías del patrón de lectura originan un codón de parada prematuro en el ARN mensajero, que podría ser degradado a nivel celular o dar lugar a una proteína truncada o con secuencia aberrante, ocasionando la consiguiente pérdida de su función.

Las herramientas bioinformáticas de predicción in silico no siempre delimitan el grado de implicación de las variantes en los defectos del splicing. Los estudios funcionales ex vivo con ARN permiten elucidar el impacto de variantes genéticas sobre el splicing y el mecanismo molecular subyacente, que redunda en un mayor conocimiento que puede trasladarse al diagnóstico clínico.