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Action ST OncoKit

Protocol automated using Magnis NGS Prep System

Descrição

Análise dos principais biomarcadores genómicos de utilidade clínica para o diagnóstico, prognóstico, sensibilidade e/ou resistência terapêutica de um amplo leque de tumores sólidos, como cancro do pulmão, da mama e colorretal, entre outros, mediante sequenciação massiva

Formato

24 reações

Tecnologia

NGS

Referência

IMG-419

Equipamentos compatíveis

NextSeq 500/550Dx System

Protocol automated using Magnis NGS Prep System
Kit Health in Code
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  • Permite a deteção de mutações pontuais (SNV), pequenas inserções e deleções (INDEL), variantes estruturais (SV), variantes do número de cópias ao longo do genoma (CNV), instabilidade de microssatélites (MSI) e variantes associadas à farmacogenética (PGx)
  • Marcação molecular com UMI que aumenta a sensibilidade da análise bioinformática
  • Software de análise incluído: Data Genomics
  • Cobertura: >99% das bases cobertas a uma profundidade de 200X
  • Uniformidade: 98% das bases cobertas a >20% da mediana de cobertura
  • Sensibilidade: > 99%
  • Especificidade: > 99%
  • O limite de deteção (LOD) de SNV, INDEL e SV é de 5%
  • O limite de deteção das CNV é de 2,4 cópias totais para ganhos, o que corresponde a 4 cópias com 30% de representação tumoral, e de 1,8 cópias totais para perdas, ou seja, 1 cópia com 20% de celularidade tumoral
Action ST OncoKit
  • Sequenciadores compatíveis: NextSeq 500/550Dx System
  • Número de reações: 24
  • Número de amostras por corrida: Mid Output v2.5 kit (150 ciclos): 8 muestras
  • Sequenciação: Paired-end (2 x 75 ciclos)
  • Quantidade de ADN por amostra: 10-200 ng
  • Região genómica analisada: 500 Kb
  • Tipo de amostra: ADN proveniente de tecido embebido em parafina
Action ST OncoKit: MSDS
Action ST OncoKit: Instruções de utilização
Certificado de análise

Action ST OncoKit

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